RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R233 179 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC3O15145 178 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNGR3O43761 229 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADRA2AP08913 450 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A16P16260 332 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT5AP41221 380 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH3B1P43353 468 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDLIM4P50479 330 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCBD1P61457 104 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTPQ5XKR4 325 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT9Q86SS6 491 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00471Q8N535 108 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T29Q8NH02 315 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT27Q9BW83 186 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUAK2Q9H093 628 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RERGLQ9H628 205 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf49A4QMS7 147 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GYG2O15488 501 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNB2O95067 398 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCKP06239 509 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP2AP10114 183 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNOP22674 350 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCP2P55851 309 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 POM121Q96HA1 1249 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSSK2Q96PF2 358 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX18Q96RF0 628 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPK1Q9H3S4 243 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 REEP1Q9H902 201 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPW3 197 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP12BA6NM10 295 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWC2LB2RUY7 222 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCTN6O00399 190 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPZL1O95297 269 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAMBPO95630 424 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLPTM1O96005 669 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GASTP01350 101 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAAP10253 952 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF250P15622 560 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD52P43351 418 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEG1Q6P5S2 330 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K13Q8NH42 304 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMNAT3Q96T66 252 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 WACQ9BTA9 647 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP13Q9UII6 198 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 U3KQV3 271 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS8O00217 210 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICMTO60725 284 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPANK1O95872 356 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP6Q13520 282 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARTPTQ16568 116 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1J1Q8NGS3 322 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS12A0PJE2 317 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 BHLHE40O14503 412 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGCEO43556 437 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms