RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 NEUROG1Q92886 237 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FBXW5Q969U6 566 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF75AQ96N20 296 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 TSSK2Q96PF2 358 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 POLE4Q9NR33 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MOKQ9UQ07 419 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 USF3Q68DE3 2245 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OR6C68A6NDL8 312 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IFNGP01579 166 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CST2P09228 141 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GRK5P34947 590 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RAB39AQ14964 217 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF611Q8N823 705 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PKP2Q99959 881 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FN3KQ9H479 309 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 S100A14Q9HCY8 104 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 B9D1Q9UPM9 204 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FKBP7Q9Y680 259 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.68□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 DCTN6O00399 190 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SERPINA5P05154 406 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CENPAP49450 140 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PCBD1P61457 104 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 HSF2Q03933 536 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PLP2Q04941 152 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GINS1Q14691 196 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OR6V1Q8N148 313 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PARP8Q8N3A8 854 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 DDOQ99489 341 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 EMC7Q9NPA0 242 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 KRT84Q9NSB2 600 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.67□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 E7EQL1 145 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PTHP01270 115 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SCG5P05408 212 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF3P17036 446 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF32P17041 273 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CALCRP30988 508 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GLO1Q04760 184 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CRMP1Q14194 572 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SYT9Q86SS6 491 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OR2T4Q8NH00 348 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 STMN2Q93045 179 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FBXO17Q96EF6 278 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CCL19Q99731 98 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 WACQ9BTA9 647 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 TEX12Q9BXU0 123 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 C1orf198Q9H425 327 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CMC2Q9NRP2 79 aa14.66□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MPZL1O95297 269 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 HMGN1P05114 100 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GAAP10253 952 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CRISP1P54107 249 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ESRRGP62508 458 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CDK5Q00535 292 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 KCNMB1Q16558 191 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.65□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms