RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSBP15848 533 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SPI1P17947 270 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCR1P25024 350 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IL12BP29460 328 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SSTR4P31391 388 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ACVR1BP36896 505 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF10P50591 281 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP15P51511 669 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAND1P57086 179 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM8P78325 824 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CD83Q01151 205 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR176Q14439 515 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 P2RY14Q15391 338 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NTRK2Q16620 822 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53I3Q53FA7 332 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LEG1Q6P5S2 330 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR135Q8IZ08 494 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T4Q8NH00 348 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF563Q8TA94 476 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DOK4Q8TEW6 326 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf49Q96BT1 292 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FKRPQ9H9S5 495 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM60AQ9NP50 221 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC7Q9NPA0 242 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BRD7Q9NPI1 651 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ABI3Q9P2A4 366 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZANQ9Y493 2812 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JMP0 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0X1KG70 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQD3 144 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C76A6NM76 312 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MCIDASD6RGH6 385 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXS1O43638 330 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A12O75746 678 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UTS2O95399 124 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC12O95881 172 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1D-16P01601 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RAF1P04049 648 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A8P0DMV1 189 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A9P0DMV2 189 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CALCBP10092 127 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FOSL1P15407 271 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PGCP20142 388 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PTNP21246 168 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A1P30531 599 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SDHAP31040 664 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GZMKP49863 264 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MEOX1P50221 254 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CCR4P51679 360 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CTXN1P60606 82 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-25P63136 954 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IFITM2Q01629 132 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAPQ12884 760 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBPHQ13203 477 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL26Q53HC5 615 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG10Q5BKT4 473 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CD276Q5ZPR3 534 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.3□□□□□ -1.4
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