RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CENPAP49450 140 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MC2RQ01718 297 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BEX5Q5H9J7 111 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C1QL3Q5VWW1 255 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC6A15Q9H2J7 730 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PRODH2Q9UF12 536 aa13.44□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CCSO14618 274 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR2F2O95006 317 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 IL33O95760 270 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BGLAPP02818 100 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CD74P04233 296 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SPARCP09486 303 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF28P17035 718 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 RAB3AP20336 220 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR2F1Q13607 317 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MOGAT2Q3SYC2 334 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NUP54Q7Z3B4 507 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MDGA2Q7Z553 956 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PARGQ86W56 976 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TMEM17Q86X19 198 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FRMD1Q8N878 549 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 HERVK_113Q902F9 699 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC6A7Q99884 636 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ADAM19Q9H013 955 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FBRSQ9HAH7 460 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KLK13Q9UKR3 277 aa13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 RNF222A6NCQ9 220 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 EPOPA6NHQ4 379 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 XKRYO14609 159 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CYB5AP00167 134 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TNFP01375 233 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PRKACAP17612 351 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CD96P40200 585 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PMPCAQ10713 525 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TAF13Q15543 124 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC18B1Q6NT16 456 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR51A2Q8NGJ7 313 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C8orf44Q96CB5 159 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SEC22AQ96IW7 307 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 A0A0G2JNG1 304 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 BLACEA4D250 179 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 LDLRAD4O15165 306 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 GP1BAP07359 652 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CD37P11049 281 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 LIPCP11150 499 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 YPEL5P62699 121 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ROM1Q03395 351 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS5Q14953 304 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ARMC6Q6NXE6 501 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CATSPERDQ86XM0 798 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 OR13H1Q8NG92 308 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PDCD10Q9BUL8 212 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CKLFQ9UBR5 152 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 VSIG4Q9Y279 399 aa13.42□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PRSS37A4D1T9 235 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C17orf51A8MQB3 221 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 C17orf105B2RV13 164 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 ABCD4O14678 606 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 CSN2P05814 226 aa13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SYP-201ENST00000263233 PDSS1Q5T2R2 415 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms