RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CCSO14618 274 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 BUB3O43684 328 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 FGF17O60258 216 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 AIFM1O95831 613 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 KLK1P06870 262 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 FAM157CP0CG43 387 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ICAM2P13598 275 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TNNI3P19429 210 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CPN2P22792 545 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SSR2P43308 183 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PKNOX1P55347 436 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SKP1P63208 163 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 HMGCS1Q01581 520 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TGM3Q08188 693 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 IFT88Q13099 833 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 IGFBP7Q16270 282 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 KRT71Q3SY84 523 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ACER2Q5QJU3 275 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 Q6ZSR9 355 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PARP8Q8N3A8 854 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 DOK4Q8TEW6 326 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CCDC126Q96EE4 140 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 C19orf60Q96EN9 201 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 LURAP1Q96LR2 239 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 C2orf48Q96LS8 159 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 AGAP4Q96P64 663 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 MED17Q9NVC6 651 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SNX6Q9UNH7 406 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.05□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 A8MUI8 341 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 DPM1O60762 260 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 MYO1DO94832 1006 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 GPR75O95800 540 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CLPTM1O96005 669 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 F10P00742 488 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 KRT6AP02538 564 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CLPSP04118 112 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 IGKV3-11P04433 115 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 KRT8P05787 483 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 BPGMP07738 259 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 FGF4P08620 206 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 THRBP10828 461 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 GLRA1P23415 457 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 GIFP27352 417 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SOX3P41225 446 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 THBS3P49746 956 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 RAP1GDS1P52306 607 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TNFRSF17Q02223 184 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 FUT7Q11130 342 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 KIAA0040Q15053 153 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ERASQ7Z444 233 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF721Q8TF20 911 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TLCD1Q96CP7 247 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 CNDP1Q96KN2 507 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ZNF681Q96N22 645 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 TRIM4Q9C037 500 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATRX-210ENST00000623316 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.04□□□□□ -1.6
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