RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 IL12BP29460 328 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RAP2BP61225 183 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LANCL3Q6ZV70 420 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 OR6N1Q8NGY5 312 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PNPLA2Q96AD5 504 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 DMRTA2Q96SC8 542 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GSX2Q9BZM3 304 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LRP12Q9Y561 859 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 HRH3Q9Y5N1 445 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 KIF26BQ2KJY2 2108 aa12□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PHYHO14832 338 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 FADS1O60427 444 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 IGHMP01871 453 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF35P13682 527 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RAB30Q15771 203 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 KDM8Q8N371 416 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD6Q9BV23 337 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PLPP3O14495 311 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 NUDT14O95848 222 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ADAM8P78325 824 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 BIKQ13323 160 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RAB11BQ15907 218 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 SMUG1Q53HV7 270 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GKN2Q86XP6 184 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GPR119Q8TDV5 335 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GPX8Q8TED1 209 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CXorf58Q96LI9 332 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPC1 479 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 WIPF3A6NGB9 483 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 XKRYO14609 159 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CSF1P09603 554 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CD37P11049 281 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CENPAP49450 140 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 OR1D5P58170 312 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.99□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL8A6PVC2 850 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GTF2F2P13984 249 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 FOLR1P15328 257 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 FMODQ06828 376 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 SYT13Q7L8C5 426 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 OR8S1Q8NH09 359 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GOSR2O14653 212 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MT-ATP6P00846 226 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CD38P28907 300 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf189Q5VU69 101 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LYPD6Q86Y78 171 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GALNT16Q8N428 558 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 SEH1LQ96EE3 360 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MSANTD3Q96H12 275 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RAB33BQ9H082 229 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 L7N2F9 121 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 LDLRAD4O15165 306 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ACSM4P0C7M7 580 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GP1BBP13224 206 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MYF5P13349 255 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 NSDHLQ15738 373 aa11.98□□□□□ -0.49
C9orf170-201ENST00000623052 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms