RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 KIRREL1Q96J84 757 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF727A8MUV8 499 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR1F1O43749 312 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 FCMRO60667 390 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CA3P07451 260 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 FAM157CP0CG43 387 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MNDAP41218 407 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CXADRP78310 365 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ACY1Q03154 408 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf17Q53FE4 359 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TEX30Q5JUR7 227 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GID4Q8IVV7 300 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 DIO2Q92813 273 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2E3Q969T4 207 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HAVCR1Q96D42 359 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 LMF1Q96S06 567 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RGCCQ9H4X1 137 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PRRT4C9JH25 899 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 H7C417 338 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PLPP1O14494 284 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SNAPC5O75971 98 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HOXB5P09067 269 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 BMP7P18075 431 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ADRA2CP18825 462 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HOXA5P20719 270 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SIRPAP78324 504 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ST3GAL3Q11203 375 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF529Q6P280 563 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM205Q6UW68 189 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 BIVMQ86UB2 503 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 DTD1Q8TEA8 209 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM19Q96E16 107 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 KXD1Q9BQD3 176 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 NBASA2RRP1 2371 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TSTD3H0UI37 97 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01565O15544 149 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GMFGO60234 142 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 RAB3DO95716 219 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SOD3P08294 240 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 AKAIN1P0CW23 69 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SSR2P43308 183 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GNG10P50151 68 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CAV2P51636 162 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 MPPED2Q15777 294 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 GXYLT1Q4G148 440 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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PTPRT-211ENST00000618610 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR4K13Q8NH42 304 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 SUSD6Q92537 303 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM235A6NFC5 223 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 CTNSO60931 367 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-211ENST00000618610 OR13C7P0DN81 318 aa7.43□□□□□ -1.22
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