RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC17A1Q14916 467 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 15.6
TRAPPC3-210ENST00000617904 SSX1Q16384 188 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 FCRLAQ7L513 359 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT77Q7Z794 578 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EMC6Q9BV81 110 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLPP2O43688 288 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF432O94892 652 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GNLYP22749 145 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RFC3P40938 356 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR12D2P58182 307 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPCS2Q15005 226 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 INAQ16352 499 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TP53I3Q53FA7 332 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARL9Q6T311 187 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF649Q9BS31 505 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLTPQ9NZD2 209 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPDZO75970 2070 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYTIPO60759 359 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT33AO76009 404 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLPXO76031 633 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALOX5APP20292 161 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 STARP49675 285 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 LHX2P50458 406 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCS1P62166 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRYQ05066 204 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARD17Q5XLA6 110 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 AAED1Q7RTV5 226 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHYHIPQ92561 330 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NSMAFQ92636 917 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRG7Q96K78 797 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMED9Q9BVK6 235 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFRPQ9BY79 579 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF122Q9H9V4 155 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCTN6O00399 190 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OGG1O15527 345 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARL6IP5O75915 188 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL1AP01583 271 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 QDPRP09417 244 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 GAAP10253 952 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPN1P15169 458 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYL9P24844 172 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 S100A5P33763 92 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTGS2P35354 604 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRYBB2P43320 205 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC3A1Q07837 685 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 S100ZQ8WXG8 99 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 AP3S1Q92572 193 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM203Q969S6 136 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCHR2Q969V1 340 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SARAFQ96BY9 339 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMIM19Q96E16 107 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR2M2Q96R28 347 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 UCN2Q96RP3 112 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 MMP27Q9H306 513 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 NIPAL2Q9H841 368 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms