RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	EBPL	Q9BY08	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	BRF2	Q9HAW0	419 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MED11	Q9P086	117 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PHF11	Q9UIL8	331 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DHDH	Q9UQ10	334 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SCO2	O43819	266 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PCDH7	O60245	1069 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	KRT36	O76013	467 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	BPGM	P07738	259 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CD28	P10747	220 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HSD3B1	P14060	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CPM	P14384	443 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SDC1	P18827	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GPX3	P22352	226 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DCTD	P32321	178 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ALDH3B1	P43353	468 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CCT5	P48643	541 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CENPA	P49450	140 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK12	P53778	367 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TUBA1B	P68363	451 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PLIN5	Q00G26	463 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TGM3	Q08188	693 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SNTA1	Q13424	505 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HBM	Q6B0K9	141 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OR2M3	Q8NG83	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RNF128	Q8TEB7	428 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TANK	Q92844	425 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SORT1	Q99523	831 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SNX6	Q9UNH7	406 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0J9YW62	118 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	ISPD	A4D126	451 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	AZIN1	O14977	448 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN9	O75954	239 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	PSMG1	O95456	288 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	KRT6A	P02538	564 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	C1QC	P02747	245 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	KRT6B	P04259	564 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MLH1-223	ENST00000616768	ATP1B1	P05026	303 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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