RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.99□□□□□ -1.29
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CAPNS1-202ENST00000586851 ING5Q8WYH8 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CAPNS1-202ENST00000586851 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SEH1LQ96EE3 360 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CAPNS1-202ENST00000586851 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GHRLQ9UBU3 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 R4GMQ9 66 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.97□□□□□ -1.29
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