RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784		Q96M85	177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SYT3	Q9BQG1	590 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	WAC	Q9BTA9	647 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784		V9GYQ6	96 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS37	A4D1T9	235 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	CRLF1	O75462	422 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	STAMBP	O95630	424 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FAM107A	O95990	144 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FABP3	P05413	133 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FAM157B	P0CG42	384 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF250	P15622	560 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MSR1	P21757	451 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	STOM	P27105	288 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	LAP3	P28838	519 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SDHA	P31040	664 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	RAD52	P43351	418 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	UCP2	P55851	309 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	PCBD1	P61457	104 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	PSG4	Q00888	419 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	CARTPT	Q16568	116 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MEST	Q5EB52	335 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SYT9	Q86SS6	491 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	LRP11	Q86VZ4	500 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PPL8	197 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	UNC119B	A6NIH7	251 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784		H7C1C5	153 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GADD45G	O95257	159 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SELENOV	P59797	346 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	LCN6	P62502	163 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SPIB	Q01892	262 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ADCK1	Q86TW2	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	DUSP13	Q9UII6	198 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FZR1	Q9UM11	496 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784		A0A1W2PPW3	197 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784		B2RBV5	119 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ICMT	O60725	284 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	TXNDC12	O95881	172 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	LCK	P06239	509 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	CTLA4	P16410	223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	FPR3	P25089	353 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GZMK	P49863	264 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	RIN1	Q13671	783 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	RASD2	Q96D21	266 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	GPA33	Q99795	319 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-231	ENST00000566784	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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