RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PLLP	Q9Y342	182 aa		2.26	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0232	Q92628	1395 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1F	O60840	1977 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PR80	420 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN3	E7EW58	273 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SMLR1	H3BR10	107 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QXV9	152 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MGRN1	O60291	552 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MPDU1	O75352	247 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DEXI	O95424	95 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9G9	P0C7N8	305 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PATE4	P0C8F1	98 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL3	P20749	454 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1E1	P30953	314 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGCL	P35914	325 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM3	P40198	252 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RFC3	P40938	356 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CSNK1D	P48730	415 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MFAP2	P55001	183 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTB	P60709	375 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTA2	P62736	377 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTG1	P63261	375 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTG2	P63267	376 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTC1	P68032	377 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTA1	P68133	377 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL2L1	Q07817	233 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IL18R1	Q13478	541 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ11	Q14654	390 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP8	Q14790	479 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SNCB	Q16143	134 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD5	Q16401	504 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRA6	Q16445	453 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC21	Q5SSG8	566 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IDNK	Q5T6J7	187 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DUPD1	Q68J44	220 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF677	Q86XU0	584 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LACC1	Q8IV20	430 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM156	Q8N614	296 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EID2	Q8N6I1	236 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PRELID2	Q8N945	189 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T33	Q8NG76	320 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51F2	Q8NH61	342 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6X1	Q8NH79	312 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MOCOS	Q96EN8	888 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PAGE5	Q96GU1	130 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX15	Q96SF7	602 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SIAE	Q9HAT2	523 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RETN	Q9HD89	108 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACP6	Q9NPH0	428 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPP	Q9NTK1	212 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PRODH2	Q9UF12	536 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA2	Q9UM82	520 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CPQ	Q9Y646	472 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMB11	A5LHX3	300 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		2.24	□□□□□ -2.05

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