RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559192.5

USP3-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3, Length 5,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-210ENST00000559192 BTF3L4Q96K17 158 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 PIGMQ9H3S5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 C12orf10Q9HB07 376 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 TCAPO15273 167 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 IL21Q9HBE4 155 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 SERINC4A6NH21 518 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 H3BML4 177 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 STK17BO94768 372 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 PGAM5Q96HS1 289 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 OR1F2PQ96R84 312 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 ZNF85Q03923 595 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 KIR2DS3Q14952 304 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 TMEM225Q6GV28 225 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 MIB2Q96AX9 1013 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 OPA3Q9H6K4 179 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 EHFQ9NZC4 300 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 MOKQ9UQ07 419 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP3-210ENST00000559192 PLXNB2O15031 1838 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 MEGF11A6BM72 1044 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 NDUFB6O95139 128 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 GPANK1O95872 356 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 ZNF44P15621 663 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-210ENST00000559192 CNR1P21554 472 aa6.49□□□□□ -1.37
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