RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 PCBD1P61457 104 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ETFDHQ16134 617 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 FAHD1Q6P587 224 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 NEUROG1Q92886 237 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF75AQ96N20 296 aa16.4■□□□□ 0.22
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RABGGTA-208ENST00000558954 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf198Q9H425 327 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGGTA-208ENST00000558954 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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RABGGTA-208ENST00000558954 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.39■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGTQ969N2 578 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 EMC7Q9NPA0 242 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 KRT84Q9NSB2 600 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 CENPAP49450 140 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 AQP6Q13520 282 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6V1Q8N148 313 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 OR2T4Q8NH00 348 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 B9D1Q9UPM9 204 aa16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 DAPP51397 102 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 GINS1Q14691 196 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNMB1Q16558 191 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF544Q6NX49 715 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP37Q8NFH4 326 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-208ENST00000558954 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.36■□□□□ 0.21
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