RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ACTA2P62736 377 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ACTG2P63267 376 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PMPCAQ10713 525 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 FAPQ12884 760 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 FOXF2Q12947 444 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 GALEQ14376 348 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 IRF3Q14653 427 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 SGCAQ16586 387 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 MEP1BQ16820 701 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NRN1LQ496H8 165 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 VWA1Q6PCB0 445 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 LINGO2Q7L985 606 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TBX5Q99593 518 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PRSS50Q9UI38 385 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TMEM129A0AVI4 362 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 IL18BPO95998 194 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 CD8BP10966 210 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 MPGP29372 298 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 OPRM1P35372 400 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 MAP2K4P45985 399 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ETV1P50549 477 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NR1H2P55055 460 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PCK2Q16822 640 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ATCAYQ86WG3 371 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 MED12LQ86YW9 2145 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 OTOSQ8NHW6 89 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 STARD4Q96DR4 205 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 DOCK7Q96N67 2140 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ALG8Q9BVK2 526 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 SIAEQ9HAT2 523 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ATMQ13315 3056 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ADRA2AP08913 450 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 LIMS3P0CW19 117 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 LIMS4P0CW20 117 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PCMT1P22061 227 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 CAPZA2P47755 286 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 TGFBR3Q03167 851 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NEDD8Q15843 81 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 FAM27BQ5VT28 67 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 Q6ZT83 130 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NAXEQ8NCW5 288 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 OR52N1Q8NH53 320 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 THEM6Q8WUY1 208 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 SNX33Q8WV41 574 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 RORBQ92753 470 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 NABP1Q96AH0 204 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 PIGMQ9H3S5 423 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 EMC7Q9NPA0 242 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 MEMO1Q9Y316 297 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX1-203ENST00000558040 CGAP01215 116 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 PTHP01270 115 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 B4GALT1P15291 398 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 ALOX5APP20292 161 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 HCCSP53701 268 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 WNT4P56705 351 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 ZNF85Q03923 595 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 EGR3Q06889 387 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 AQP6Q13520 282 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 BLMHQ13867 455 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 BEND4Q6ZU67 534 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 ZNF627Q7L945 461 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 RND1Q92730 232 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.83□□□□□ -0.04
SNX1-203ENST00000558040 WACQ9BTA9 647 aa14.83□□□□□ -0.04
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