RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557005.1

SYNE2-223, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, human

TSL 2

Gene SYNE2, Length 5,804 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNE2-223	ENST00000557005	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	MYLK	Q15746	1914 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	NDUFB6	O95139	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	GPR75	O95800	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	IFNA10	P01566	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HPX	P02790	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	IFNA4	P05014	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CNR1	P21554	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PTAFR	P25105	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SLC6A8	P48029	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ASCL1	P50553	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TAS2R46	P59540	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	STAC	Q99469	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	GPR31	O00270	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	FGF17	O60258	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TBXA2R	P21731	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CDKN3	Q16667	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HAGH	Q16775	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005		Q6ZRG5	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	XRCC3	O43542	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PLPP2	O43688	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CD160	O95971	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ITGB2	P05107	769 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ZNF84	P51523	738 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	RUNX3	Q13761	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	MLC1	Q15049	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	WNT2B	Q93097	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	ANK1	P16157	1881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005		A0A1W2PR64	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005		A0A1W2PRV1	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005		H7C1Q1	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	PPM1D	O15297	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYNE2-223	ENST00000557005	G0S2	P27469	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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