RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MCHR2	Q969V1	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CMKLR1	Q99788	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0G2JMP0	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0X1KG70	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GVI7	797 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CPED1	A4D0V7	1026 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ACOD1	A6NK06	481 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		B4E171	279 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MEN1	O00255	615 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DNPH1	O43598	174 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SIGLEC6	O43699	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PEX14	O75381	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINI2	O75830	405 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NCR1	O76036	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	VAMP5	O95183	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C1QB	P02746	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	F13B	P05160	661 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SFTPC	P11686	197 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ATF1	P18846	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FST	P19883	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C4BPB	P20851	252 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGS2	P35354	604 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPAN7	P41732	249 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CCL7	P80098	99 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR176	Q14439	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C4orf45	Q96LM5	186 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	LMF1	Q96S06	567 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CTSF	Q9UBX1	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	XRCC3	O43542	346 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PTN	P21246	168 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DPP4	P27487	766 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP16	P51512	607 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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