RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 EMDP50402 254 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GMFBP60983 142 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ACTA2P62736 377 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ACTG2P63267 376 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 DUSP8Q13202 625 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 OR7A5Q15622 319 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 DCST2Q5T1A1 773 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 FAM219AQ8IW50 185 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 BEST3Q8N1M1 668 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GALNT16Q8N428 558 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 OR2L5Q8NG80 312 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 MOAP1Q96BY2 351 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 MICU1Q9BPX6 476 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GPR27Q9NS67 375 aa8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 FAM25EA8MYX2 175 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 OR4E1P0C645 316 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 NID1P14543 1247 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 BLKP51451 505 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ATP1B3P54709 279 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ELOCQ15369 112 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GUSBP11Q6P575 273 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 EID2Q8N6I1 236 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 RELTQ969Z4 430 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CMTM3Q96MX0 182 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GAREM1Q9H706 876 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TMEM72A0PK05 275 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 OR5H14A6NHG9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 SULT1B1O43704 296 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GPANK1O95872 356 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CSN2P05814 226 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 RFC3P40938 356 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 HLA-BQ31612 363 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CDK20Q8IZL9 346 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 EDARQ9UNE0 448 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 GGT3PA6NGU5 568 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 C2orf74A8MZ97 194 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 FADS1O60427 444 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CTAG2O75638 210 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 SLC6A6P31641 620 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CSF2RBP32927 897 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 DLSTP36957 453 aa8.24□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 PNLIPRP2P54317 469 aa8.24□□□□□ -1.09
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THBS3-211ENST00000541990 POU4F2Q12837 409 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 OOSP2Q86WS3 158 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 EDAQ92838 391 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 A0A0B4J2E0 115 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GX12 115 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-211ENST00000541990 H7C1C5 153 aa8.24□□□□□ -1.09
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