RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CIB1	Q99828	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PDLIM1	O00151	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	P2RX6	O15547	441 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TPST1	O60507	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	DPM1	O60762	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C6orf47	O95873	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SEMG1	P04279	462 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	IL3	P08700	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	UQCRC2	P22695	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CMPK1	P30085	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ACTR1B	P42025	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEA2	P43356	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEB1	P43366	347 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ACTR1A	P61163	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NRF1	Q16656	503 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CARM1	Q86X55	608 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	GGH	Q92820	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	UCN3	Q969E3	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	VCX	Q9H320	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		Q9H521	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		A8MU76	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		G3V2T6	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		M0QX08	132 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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