RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRL4Q9HBW9 690 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 JKAMPQ9P055 326 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 39.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MOKQ9UQ07 419 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CIB4A0PJX0 185 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V1E1P36543 226 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM8P78325 824 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35D3Q5M8T2 416 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 STAC2Q6ZMT1 411 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TIGD4Q8IY51 512 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 RFLNBQ8N5W9 214 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6N2Q8NGY6 317 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GGHQ92820 318 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF416Q9BWM5 594 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT8Q9NY28 637 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MYRFQ9Y2G1 1151 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 LRCH1Q9Y2L9 728 aa19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF224P0DH78 156 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GRNP28799 593 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SKA3Q8IX90 412 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A24Q8N4F4 322 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1K1Q8NGR3 316 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 LILRB4Q8NHJ6 448 aa19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SPARCP09486 303 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 COX5AP20674 150 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 AHSA2Q719I0 299 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 DPY19L4Q7Z388 723 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS14Q96SY0 518 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 HLA-HP01893 362 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MSR1P21757 451 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 STK11Q15831 433 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SFRP5Q5T4F7 317 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ALKBH2Q6NS38 261 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM154Q6P9G4 183 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF540Q8NDQ6 660 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO17Q96EF6 278 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ASH2LQ9UBL3 628 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNG2Q9UJ96 466 aa19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO18BQ8IUG5 2567 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 FLNCQ14315 2725 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SBK2P0C263 348 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CRHBPP24387 322 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPZA2P47755 286 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRA6Q16445 453 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 LCN1P1Q5VSP4 162 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52I1Q8NGK6 324 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SIAEQ9HAT2 523 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR1DQ9Y2S0 133 aa19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 WNT11O96014 354 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF823P16415 610 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC15A1P46059 708 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 P2RY6Q15077 328 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 C22orf34Q6ZV56 151 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATC1Q76KD6 591 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10H4Q8NGA5 316 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 AMELYQ99218 206 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF224Q9NZL3 707 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 COPS3Q9UNS2 423 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 LHFPL6Q9Y693 200 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 SNTNA6NMZ2 147 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR8G3PP0DMU2 310 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CCKARP32238 428 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH15P55291 814 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 GGTLC2Q14390 218 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 TBRG1Q3YBR2 411 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MTFR2Q6P444 385 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD16Q6P6B7 361 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10H5Q8NGA6 315 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB5Q8WWX0 329 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 S100PBPQ96BU1 408 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 CDADC1Q9BWV3 514 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 NOX3Q9HBY0 568 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 HAO2Q9NYQ3 351 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-18Q9QC07 812 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 COL12A1Q99715 3063 aa19.89■□□□□ 0.78
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMD9O00233 223 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 RER1O15258 196 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-208ENST00000524325 PLA2G2AP14555 144 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms