RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPS2	P11908	318 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NQO2	P16083	231 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	VDAC1	P21796	283 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PTGDS	P41222	190 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	RGR	P47804	291 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GPX6	P59796	221 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V0D1	P61421	351 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GNB1	P62873	340 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PAX2	Q02962	417 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NCF4	Q15080	339 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PID1	Q7Z2X4	250 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ERO1B	Q86YB8	467 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PAGE5	Q96GU1	130 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF597	Q96LX8	424 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TSSK3	Q96PN8	268 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	F2RL3	Q96RI0	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NAT9	Q9BTE0	207 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CHID1	Q9BWS9	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PHLPP1	O60346	1717 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL9	O00512	1426 aa		3.18	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GLI3	P10071	1580 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NRAP	Q86VF7	1730 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GW55	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ENTPD5	O75356	428 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A10	O95528	541 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CD160	O95971	181 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	AMBP	P02760	352 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINA5	P05154	406 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF1	P05230	155 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	LMO2	P25791	158 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	IL12B	P29460	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	GSK3B	P49841	420 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC26A2	P50443	739 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PLK1	P53350	603 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SKP1	P63208	163 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ECH1	Q13011	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CALCOCO2	Q13137	446 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAM2	Q15035	370 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	VAMP3	Q15836	100 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMD5	Q16401	504 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP15	Q460N3	678 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	ARC	Q7LC44	396 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.17	□□□□□ -1.9
FAM49B-222	ENST00000522702	HES7	Q9BYE0	225 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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