RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS37A4D1T9 235 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2C1P13056 603 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SDHAP31040 664 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GALK2Q01415 458 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 POM121Q96HA1 1249 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBP7Q96R05 134 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52D1Q9H346 318 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 POLE4Q9NR33 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 XKRYO14609 159 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ENTPD5O75356 428 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GPANK1O95872 356 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FPR3P25089 353 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GLRXP35754 106 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PSG4Q00888 419 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 HSF2Q03933 536 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MTX3Q5HYI7 312 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM27BQ5VT28 67 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DHFR2Q86XF0 187 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM168AQ92567 244 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH20Q9HBT6 801 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CMAHPQ9Y471 501 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP7Q9Y680 259 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DCTN6O00399 190 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAP29O95721 258 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP4P12644 408 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MSR1P21757 451 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT5AP41221 380 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH3B1P43353 468 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GSSP48637 474 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM11AP58511 58 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FNDC8Q8TC99 324 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB9Q96DX5 294 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD8Q96LT4 415 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TSSK2Q96PF2 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 THTPAQ9BU02 230 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC13Q9H3R2 512 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FN3KQ9H479 309 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RERGLQ9H628 205 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 EGLN3Q9H6Z9 239 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 INAFM1C9JVW0 142 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT8O14734 319 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MPZL1O95297 269 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC12O95881 172 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CLPTM1O96005 669 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRA2AP08913 450 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CST2P09228 141 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNOP22674 350 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 STOMP27105 288 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CARTPTQ16568 116 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF774Q6NX45 483 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf21Q9H246 121 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 HIVEP2P31629 2446 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF11BO00300 401 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A7O60669 478 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PCSK6P29122 969 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 APLNRP35414 380 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GLO1Q04760 184 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PLP2Q04941 152 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms