RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 STPG2Q8N412 459 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FTMTQ8N4E7 242 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 HLA-CQ95604 372 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 C8orf44Q96CB5 159 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SHDQ96IW2 340 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 C4orf45Q96LM5 186 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 COPZ2Q9P299 210 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 VDAC3Q9Y277 283 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OPN1LWP04000 364 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 HEXBP07686 556 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CDK2P24941 298 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CCL7P80098 99 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 LCN10Q6JVE6 187 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ST8SIA4Q92187 359 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPL8 197 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PQM1 296 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 GDF9O60383 454 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 AHSA1O95433 338 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MT-ATP6P00846 226 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FMODQ06828 376 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR8B4Q96RC9 309 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLITRK2Q9H156 845 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR10A4Q9H209 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DIABLOQ9NR28 239 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FKBP7Q9Y680 259 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR6C76A6NM76 312 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CCR9P51686 369 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ZP1P60852 638 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ADAM8P78325 824 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EGR3Q06889 387 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CAMK2DQ13557 499 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC17A1Q14916 467 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ALKAL2Q6UX46 152 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KMT5CQ86Y97 462 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR56B4Q8NH76 319 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 GPR148Q8TDV2 347 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 APMAPQ9HDC9 416 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 HRASLSQ9HDD0 168 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MS4A18H0YCH9 400 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EFNB2P52799 333 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR7A5Q15622 319 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 COQ8AQ8NI60 647 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DLL4Q9NR61 685 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CTDSPLO15194 276 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ZNF254O75437 659 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PLATP00750 562 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ALDOBP05062 364 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RRASP10301 218 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CCKBRP32239 447 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 VEGFCP49767 419 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ART1P52961 327 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms