RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MEST	Q5EB52	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792		M0R3G1	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	IDH3B	O43837	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR6A2	O95222	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SLC2A10	O95528	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GPANK1	O95872	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINA5	P05154	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	FABP3	P05413	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	QDPR	P09417	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UMPS	P11172	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	B4GALT1	P15291	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	NR4A1	P22736	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PCSK6	P29122	969 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF83	P51522	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RAB1A	P62820	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ETFDH	Q16134	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	RFX4	Q33E94	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OAF	Q86UD1	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MDP1	Q86V88	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DOK1	Q99704	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CCL19	Q99731	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-208	ENST00000485792	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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