RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481849.5

HLA-B-253, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-253	ENST00000481849	TAS2R41	P59536	307 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SELENOV	P59797	346 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	HSF2	Q03933	536 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC36A2	Q495M3	483 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	DPP10	Q8N608	796 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SNX33	Q8WV41	574 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	NSMAF	Q92636	917 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM186	Q96B77	213 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	NANOG	Q9H9S0	305 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	C17orf100	A8MU93	164 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PIP5K1C	O60331	668 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ENTPD5	O75356	428 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	RP2	O75695	350 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	OR7A10	O76100	309 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	VENTX	O95231	258 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC2A10	O95528	541 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	FUT1	P19526	365 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	DRD4	P21917	467 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	OR1E2	P47887	323 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	GZMM	P51124	257 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF84	P51523	738 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	CRYBA2	P53672	197 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	UGT2B15	P54855	530 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM33	P57088	247 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PLP2	Q04941	152 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	FMOD	Q06828	376 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SGCA	Q16586	387 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	RABL3	Q5HYI8	236 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	REP15	Q6BDI9	236 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ASB10	Q8WXI3	467 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SGTB	Q96EQ0	304 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MPP4	Q96JB8	637 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MAGEB18	Q96M61	343 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	INIP	Q9NRY2	104 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	CACNG2	Q9Y698	323 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	FBP2	O00757	339 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	SPRY3	O43610	288 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	TF	P02787	698 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MT-ND1	P03886	318 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF250	P15622	560 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ACADS	P16219	412 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF32	P17041	273 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	APLNR	P35414	380 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	RAD52	P43351	418 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	UCP2	P55851	309 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	LMO4	P61968	165 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	USP51	Q70EK9	711 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HLA-B-253	ENST00000481849	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18

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