RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477347.1

RPSAP55-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP55, Length 876 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP55-201ENST00000477347 AMELYQ99218 206 aa8.64□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 SH3GL3Q99963 347 aa8.64□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 CENPMQ9NSP4 180 aa8.64□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.64□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.64□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.64□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 CENPBD1B2RD01 187 aa8.63□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 PCMT1P22061 227 aa8.63□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 TAF13Q15543 124 aa8.62□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.62□□□□□ -1.03
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RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.62□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.62□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 OR2T27Q8NH04 317 aa8.62□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 OR52N5Q8NH56 324 aa8.62□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 OTOSQ8NHW6 89 aa8.62□□□□□ -1.03
RPSAP55-201ENST00000477347 NABP1Q96AH0 204 aa8.62□□□□□ -1.03
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