RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 BGNP21810 368 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB5P36952 375 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 STX3Q13277 289 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CLINT1Q14677 625 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF726P1Q15940 193 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 UTF1Q5T230 341 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX26Q7Z412 305 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CPB2Q96IY4 423 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB12Q96P63 405 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CYTH2Q99418 400 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 APOL2Q9BQE5 337 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CNPY3Q9BT09 278 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM15Q9C019 465 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ASF1AQ9Y294 204 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 POFUT2Q9Y2G5 429 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0B4J2A0 478 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPR1 153 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EMT4 169 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD51CO43502 376 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AQP8O94778 261 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OXTP01178 125 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GDF1P27539 372 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FMO3P31513 532 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1A1P48729 337 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 COTL1Q14019 142 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7A5Q15622 319 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL5BQ96KC2 179 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DL4Q99706 377 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 EBF4Q9BQW3 602 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 VCX3AQ9NNX9 186 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AIG1Q9NVV5 245 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 XCL2Q9UBD3 114 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPP5Q9UJA9 477 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 V9GYY9 64 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AK9Q5TCS8 1911 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GW15 77 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 LCA5LO95447 670 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AIFM1O95831 613 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-13P01766 116 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CATP04040 527 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RPN2P04844 631 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CALM1P0DP23 149 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CALM2P0DP24 149 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CALM3P0DP25 149 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB4AP20338 218 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB8P50452 374 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NRF1Q16656 503 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FANK1Q8TC84 345 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GTSF1Q8WW33 167 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RASL10AQ92737 203 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RPEQ96AT9 228 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RX4Q99571 388 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3GL3Q99963 347 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SRMSQ9H3Y6 488 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 VSIG4Q9Y279 399 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms