RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 GLO1Q04760 184 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 EGR3Q06889 387 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 COMMD2Q86X83 199 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 FAM46BQ96A09 425 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CKLFQ9UBR5 152 aa14.71□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CTDSPLO15194 276 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 DCAF7P61962 342 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TLE3Q04726 772 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GRINAQ7Z429 371 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 LIPHQ8WWY8 451 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 M0QYG6 137 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 PLPP3O14495 311 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CTAG2O75638 210 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CD3DP04234 171 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CD1AP06126 327 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CD2P06729 351 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GALNSP34059 522 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 C4orf46Q504U0 113 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 UCK1Q9HA47 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.7□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SDK2Q58EX2 2172 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CIB4A0PJX0 185 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GGT3PA6NGU5 568 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TEX46H3BTG2 121 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 P2RY10O00398 339 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 RAF1P04049 648 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GLB1P16278 677 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 PNLIPRP2P54317 469 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 PUDPQ08623 228 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 DMWDQ09019 674 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 C10orf142B7Z368 130 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 H3BMH7 237 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 FOXK1P85037 733 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GRK1Q15835 563 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 D2HGDHQ8N465 521 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 MVB12AQ96EY5 273 aa14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 M0R233 179 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SLC22A5O76082 557 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ACBD4Q8NC06 268 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 EXO5Q9H790 373 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 I3L521 148 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 XRCC3O43542 346 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 GDF9O60383 454 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 PRSS3P35030 304 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 FOXF1Q12946 379 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 BIVMQ86UB2 503 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 A0A1W2PPL8 197 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 ZNF432O94892 652 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 MPC2O95563 127 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 MT-ATP6P00846 226 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SLC2A1P11166 492 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 SFTPDP35247 375 aa14.68□□□□□ -0.06
SLX4-202ENST00000466154 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms