RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF485Q8NCK3 441 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR56A1Q8NGH5 318 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CENPMQ9NSP4 180 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HCSTQ9UBK5 93 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 E9PQ18 207 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 XRCC3O43542 346 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR2T7P0C7T2 308 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SPRYD7Q5W111 196 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR2T27Q8NH04 317 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 WDR81Q562E7 1941 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CTDSPLO15194 276 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TRGC2P03986 189 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HEXAP06865 529 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 THBS1P07996 1170 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DPP4P27487 766 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MPPED2Q15777 294 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FATE1Q969F0 183 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 IL36AQ9UHA7 158 aa13.56□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PIN1P1O15428 100 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPR89BP0CG08 455 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OMGP23515 440 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GDI1P31150 447 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TLE1Q04724 770 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ELOCQ15369 112 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RAB42Q8N4Z0 105 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF563Q8TA94 476 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPR148Q8TDV2 347 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DIO2Q92813 273 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PARPBPQ9NWS1 579 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DBX1A6NMT0 343 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 EMC8O43402 210 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 C1orf105O95561 183 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 NECAP1Q8NC96 275 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR9K2Q8NGE7 335 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR51F2Q8NH61 342 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CLDND1Q9NY35 253 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 A0A0U1RQF3 1178 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MSGN1A6NI15 193 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 C11orf98E9PRG8 122 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CNMDO75829 334 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 F13BP05160 661 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CD37P11049 281 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GALP22466 123 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 IGFALSP35858 605 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ACSM1Q08AH1 577 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LMAN2Q12907 356 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DCAF4L2Q8NA75 395 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DTD2Q96FN9 168 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPER1Q99527 375 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TRIM2Q9C040 744 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HSF4Q9ULV5 492 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR5H15A6NDH6 313 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR5H1A6NKK0 313 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FHITP49789 147 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GATMP50440 423 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CYCSP99999 105 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 STPG1Q5TH74 334 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPR142Q7Z601 462 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SLC41A2Q96JW4 573 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PRRT1Q99946 306 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GAB2Q9UQC2 676 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MEMO1Q9Y316 297 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LEFTY2O00292 366 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PEX12O00623 359 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TCF21O43680 179 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPRIN2O60269 458 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms