RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 UBL3O95164 117 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB2O95178 105 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC12O95881 172 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYAAP02489 173 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA5P05154 406 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 INHBBP09529 407 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PSKH1P11801 424 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LAP3P28838 519 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 BNIP1Q12981 228 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 MEP1BQ16820 701 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 SPATS1Q496A3 300 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 THEM4Q5T1C6 240 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RRM2BQ7LG56 351 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF525Q8N782 197 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP37Q8NFH4 326 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-206ENST00000461017 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF570Q96NI8 536 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG12Q9BV10 488 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51B6Q9H340 312 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52D1Q9H346 318 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 FN3KQ9H479 309 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 POFUT1Q9H488 388 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 PLK3Q9H4B4 646 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF121Q9H920 327 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SIAEQ9HAT2 523 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC7Q9NPA0 242 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NDE1Q9NXR1 346 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 AURKCQ9UQB9 309 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KQV3 271 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPL8 197 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C417 338 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 RAB36O95755 333 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM157BP0CG42 384 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LYNX1P0DP58 116 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA2P17301 1181 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINF1P36955 418 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF84P51523 738 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN31Q12999 210 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 OCLNQ16625 522 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM27BQ5VT28 67 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF774Q6NX45 483 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6V1Q8N148 313 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T29Q8NH02 315 aa6.02□□□□□ -1.45
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