RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 UBOX5O94941 541 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TGDSO95455 350 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV2-70P01814 119 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CD247P20963 164 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TNFSF4P23510 183 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 OMGP23515 440 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ARHGDIAP52565 204 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 FMODQ06828 376 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 NRN1LQ496H8 165 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 AGKQ53H12 422 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ESCO2Q56NI9 601 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 LEG1Q6P5S2 330 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CROCCP2Q86T23 111 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PFN4Q8NHR9 129 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 SIAEQ9HAT2 523 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 INIPQ9NRY2 104 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 NOTCH1P46531 2555 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPL8 197 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PPIAL4DF5H284 164 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 M0QX08 132 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MGRN1O60291 552 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 THY1P04216 161 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ACADSP16219 412 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF12P17014 697 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 GSTM3P21266 225 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 LIPAP38571 399 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 AQP2P41181 271 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 UGT2B15P54855 530 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MTPNP58546 118 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 BTG1P62324 171 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PSG4Q00888 419 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP7Q16829 419 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MTX3Q5HYI7 312 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf128Q5T292 105 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 EPGNQ6UW88 154 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PARP8Q8N3A8 854 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MPP4Q96JB8 637 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 NANOGQ9H9S0 305 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 GMNCA6NCL1 334 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 POM121CA8CG34 1229 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CENPBD1B2RD01 187 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 OR7A10O76100 309 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 LYPD3O95274 346 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD16AO95870 558 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 NGFP01138 241 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 CD55P08174 381 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 NR2C1P13056 603 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 GPX2P18283 190 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-211ENST00000449757 FUT1P19526 365 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms