RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCR9P51686 369 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 UCNP55089 124 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCN6P62502 163 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 MELKQ14680 651 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 NRN1LQ496H8 165 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 FCRLAQ7L513 359 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC190Q86UF4 302 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT14Q8NB59 555 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 PELI1Q96FA3 418 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2M2Q96R28 347 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 UCN2Q96RP3 112 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.21□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 COPS3Q9UNS2 423 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.21□□□□□ -1.09
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM127O75204 238 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 UPK3AO75631 287 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SYNGR4O95473 234 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABHD16AO95870 558 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DQA2P01906 255 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRT8P05787 483 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 QDPRP09417 244 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPR2P20594 1047 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 HCCSP53701 268 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CAMK2DQ13557 499 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK5R1Q15078 307 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETFDHQ16134 617 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSX6Q7RTT6 188 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF128Q8TEB7 428 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 THRSPQ92748 146 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM19Q96E16 107 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 OR8B4Q96RC9 309 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC32Q9BV29 185 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MROQ9BYG7 248 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.2□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIPAL2Q9H841 368 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 GLRX2Q9NS18 164 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 EMC3Q9P0I2 261 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF175Q9Y473 711 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.2□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR14I1A6ND48 311 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM166BA8MTA8 275 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 H0YC42 278 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3QRK9 145 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 GABRPO00591 440 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 AQP7O14520 342 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC43A1O75387 559 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CELA3AP09093 270 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTSSP25774 331 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD79BP40259 229 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSNK1A1P48729 337 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 MTNR1BP49286 362 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CCNDBP1-202ENST00000444658 FABP5Q01469 135 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.18e-7■■■■□ 21.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 LIPNQ5VXI9 398 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 C22orf42Q6IC83 251 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF544Q6NX49 715 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPRA1Q86W33 373 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 GHDCQ8N2G8 530 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABHD4Q8TB40 342 aa8.19□□□□□ -1.1
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