RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A0G2JN53 185 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRSS37A4D1T9 235 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 A8MUA0 341 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSMD11O00231 422 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM189A1O60320 539 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPM1O60762 260 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ICOSLGO75144 302 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FKBP6O75344 327 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 AIFM1O95831 613 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT16P08779 473 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TACSTD2P09758 323 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSF3P09919 207 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TDGF1P13385 188 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CFHR2P36980 270 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 RFC3P40938 356 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TDGF1P3P51864 188 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRPS1P60891 318 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF726P1Q15940 193 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCN12Q6JVE5 192 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 H2AFVQ71UI9 128 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FANK1Q8TC84 345 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 MARC2Q969Z3 335 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 B3GALT6Q96L58 329 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1B0GW55 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 H3BNH8 94 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 YKT6O15498 198 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMP23AO75900 390 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 UTS2O95399 124 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CALM1P0DP23 149 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CALM2P0DP24 149 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CALM3P0DP25 149 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PMCHP20382 165 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 MXD1Q05195 221 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DMTNQ08495 405 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCAN2Q14206 197 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCNJQ5T5M9 372 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ASCL4Q6XD76 172 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD177Q8N6Q3 437 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITFG1Q8TB96 612 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ISOC2Q96AB3 205 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 APH1AQ96BI3 265 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 C16orf74Q96GX8 76 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXC2Q99958 501 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUX4Q9UBX2 424 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 A6NDN8 102 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC22A20A6NK97 555 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUPT7LO94864 414 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 APOA1P02647 267 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARG1P05089 322 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 GABRR2P28476 465 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 HRH1P35367 487 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSKP41240 450 aa3.13□□□□□ -1.91
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