RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 DYSFO75923 2080 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WUU8 490 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 A0A0G2JMP0 313 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 A0A0X1KG70 313 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PRQ8 180 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 CENPBD1B2RD01 187 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ARPC2O15144 300 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 WIPF1O43516 503 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PIP5K1CO60331 668 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 OR6A2O95222 327 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 IGHMP01871 453 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MT-ND5P03915 603 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PGA4P0DJD7 388 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PGA3P0DJD8 388 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 RHCEP18577 417 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 FUT1P19526 365 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LIMS1P48059 325 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 BIDP55957 195 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LMO4P61968 165 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TEKQ02763 1124 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 DGCR6Q14129 220 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TRAM2Q15035 370 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 C1orf198Q9H425 327 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TMEM89A2RUT3 159 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 C17orf100A8MU93 164 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 C11orf98E9PRG8 122 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 CDC14BO60729 498 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MPZL1O95297 269 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 FAM157BP0CG42 384 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MAKP20794 623 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 IFNA8P32881 189 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MAGEB1P43366 347 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 YAP1P46937 504 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 CCL8P80075 99 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TMEM53Q6P2H8 277 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 DPPA2Q7Z7J5 298 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ZNF584Q8IVC4 421 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SKA3Q8IX90 412 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 NRMQ8IXM6 262 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SYNPRQ8TBG9 265 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ASB10Q8WXI3 467 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ZNF566Q969W8 418 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PYURFQ96I23 114 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 CDH20Q9HBT6 801 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 GLTPQ9NZD2 209 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 B2RBV5 119 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 J3QLI3 93 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 RNF13O43567 381 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PTHP01270 115 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LCKP06239 509 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 PATE4P0C8F1 98 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 IFI30P13284 250 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 ZNF250P15622 560 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 AQP2P41181 271 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 RAD52P43351 418 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MAGEA2P43356 314 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC9A3P48764 834 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MVKQ03426 396 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 MOGQ16653 247 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D28Q2M2D7 210 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 SLC36A2Q495M3 483 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 AVPI1Q5T686 147 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LCN8Q6JVE9 175 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-204ENST00000403441 C1QL2Q7Z5L3 287 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms