RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 ARL6IP1Q15041 203 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 COMTD1Q86VU5 262 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 COX14Q96I36 57 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 ATF6BQ99941 703 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 PPA2Q9H2U2 334 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 NIPAL2Q9H841 368 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 POMT2Q9UKY4 750 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.72□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 GUSBP08236 651 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 ARG2P78540 354 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 OR2L13Q8N349 312 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 WDR34Q96EX3 536 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 CALHM2Q9HA72 323 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 CDH20Q9HBT6 801 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SNAPC5O75971 98 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 RAB6AP20340 208 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 HSF1Q00613 529 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 FCRL6Q6DN72 434 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 WBP1LQ9NX94 342 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 CTSFQ9UBX1 484 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 WASF3Q9UPY6 502 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 EPXP11678 715 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SSR4P51571 173 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SELENOVP59797 346 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.71□□□□□ -0.05
SYT6-201ENST00000369547 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 GABARAPH6UMI1 98 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ARHGDIGQ99819 225 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 PADI1Q9ULC6 663 aa14.71□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 OR2J2O76002 312 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 CX3CR1P49238 355 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ARL11Q969Q4 196 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ATF1P18846 271 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 M6PRP20645 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 SLAMF9Q96A28 289 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 RFC3P40938 356 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 AKR1C1Q04828 323 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 FAM53BQ14153 422 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 MKXQ8IYA7 352 aa14.7□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 ZNF254O75437 659 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 STK17BO94768 372 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 CD3DP04234 171 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 RPA2P15927 270 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 GZMMP51124 257 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 MAP2K6P52564 334 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 DUSP2Q05923 314 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 PELI1Q96FA3 418 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 GPA33Q99795 319 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 STMND1H3BQB6 276 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 AIPO00170 330 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 MT-ATP6P00846 226 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 C1QBP02746 253 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 QDPRP09417 244 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 CARD18P57730 90 aa14.69□□□□□ -0.06
SYT6-201ENST00000369547 TAS2R31P59538 309 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms