RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361311.4

CLSTN1-201, Transcript of calsyntenin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN1, Length 4,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF264O43296 627 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TBX19O60806 448 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ZFPL1O95159 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 MPC2O95563 127 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 CTSAP10619 480 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 F2RL1P55085 397 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 C1orf61Q13536 156 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 FGGYQ96C11 551 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 STACQ99469 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 HIDE1A8MVS5 230 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 C17orf105B2RV13 164 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TAAR5O14804 337 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TNFSF12O43508 249 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 JTBO76095 146 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 GABRR1P24046 479 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 FAM26DQ5JW98 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 OMGP23515 440 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 MLC1Q15049 377 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 OR6S1Q8NH40 331 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 CA10Q9NS85 328 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 CSF2RAP15509 400 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SERPINA2P20848 420 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 CX3CR1P49238 355 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 DHRS2Q13268 280 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SERTAD2Q14140 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC36A2Q495M3 483 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC6A18Q96N87 628 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 OR5K4A6NMS3 321 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN1-201ENST00000361311 YKT6O15498 198 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 SFTA3P0C7M3 94 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ATP1B3P54709 279 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 FRZBQ92765 325 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 SCN4AP35499 1836 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 APBB3O95704 486 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ITGB2P05107 769 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 TEX19Q8NA77 164 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 CHRDQ9H2X0 955 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 NTN1O95631 604 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 PI3P19957 117 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 FCRL6Q6DN72 434 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 OPN5Q6U736 354 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 P2RY2P41231 377 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ERV3-1Q14264 604 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN1-201ENST00000361311 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms