RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 SQSTM1Q13501 440 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOBQ15370 118 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0G2JNG1 304 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CLDN1O95832 211 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LCATP04180 440 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 NQO2P16083 231 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 KIR2DS5Q14953 304 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR52W1Q6IF63 320 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 TRNP1Q6NT89 227 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNK6Q9Y257 313 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CEBPEQ15744 281 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SYS1Q8N2H4 156 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35G3Q8N808 338 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPNS2Q96L46 248 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LPAR4Q99677 370 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR13C7P0DN81 318 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2T2Q6IF00 324 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 MANBALQ9NQG1 85 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PRU2 124 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF98A6NK75 572 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OMGP23515 440 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 EVX1P49640 407 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD4Q8TB40 342 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR78Q96P69 363 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PIRO00625 290 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ACHEP22303 614 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXJ1Q92949 421 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 STACQ99469 402 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 GFRA2O00451 464 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC3BP05452 202 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 WNT7BP56706 349 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ERASQ7Z444 233 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 J3KTA2 159 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 TCAPO15273 167 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 FUT1P19526 365 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 HNF1AP20823 631 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 OR51F2Q8NH61 342 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF596Q8TC21 504 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR119Q8TDV5 335 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 NPAS1Q99742 590 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SGPP1Q9BX95 441 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087X0M5 115 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GX30 115 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 CD80P33681 288 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 TGFBR1P36897 503 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 XAF1Q6GPH4 301 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP5SQ99766 215 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 GKN1Q9NS71 199 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 POMT2Q9UKY4 750 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 MTHFD2P13995 350 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 PTTG1IPP53801 180 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF90Q03938 601 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms