RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 WNT11O96014 354 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FURINP09958 794 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SDC1P18827 310 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ARR3P36575 388 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PAFAH1B2P68402 229 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SIAH3Q8IW03 269 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.53□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 SOX7Q9BT81 388 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35B3Q9H1N7 401 aa4.53□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 K7ERU9 68 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 C1orf105O95561 183 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 PLPP2O43688 288 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 STC2O76061 302 aa4.52□□□□□ -1.69
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