RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335509.10

TPCN1-201, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPCN1, Length 5,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-201ENST00000335509 SLC43A2Q8N370 569 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CSF3RQ99062 836 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 DUSP13Q9UII6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ALS2Q96Q42 1657 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TMEM221A6NGB7 291 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 LALBAP00709 142 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CHRM2P08172 466 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ENPP1P22413 925 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 FCRL6Q6DN72 434 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TSLPQ969D9 159 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 A8MXE2 369 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 D6RAR5 112 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 GMDSO60547 372 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 GUSBP08236 651 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SNCAP37840 140 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 METAP1P53582 386 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 GPR85P60893 370 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CAMK2BQ13554 666 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 OR10K2Q6IF99 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 HLA-CQ95604 372 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 HTD2P86397 168 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TPBGQ13641 420 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ABHD6Q9BV23 337 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 A0A1W2PNR3 127 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 E9PI62 339 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TNFSF4P23510 183 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 P2RX1P51575 399 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 AKR1C1Q04828 323 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 Q6ZNB5 142 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 BCORP1Q8N888 145 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PXT1Q8NFP0 134 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ARGFXA6NJG6 315 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 GPR171O14626 319 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 KITLGP21583 273 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PTGER4P35408 488 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CATR1Q13166 79 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 PGAP1Q75T13 922 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 MUCL1Q96DR8 90 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SDHAP31040 664 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TEKQ02763 1124 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SHHQ15465 462 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 C3orf49Q96BT1 292 aa14.59□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 CNR1P21554 472 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 RUNX2Q13950 521 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 AGERQ15109 404 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 FKRPQ9H9S5 495 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 TBX21Q9UL17 535 aa14.58□□□□□ -0.07
TPCN1-201ENST00000335509 SGCEO43556 437 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ICMTO60725 284 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 CLDN1O95832 211 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 CSF3P09919 207 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 GNB3P16520 340 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 BAK1Q16611 211 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 PIGQQ9BRB3 760 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 MED29Q9NX70 200 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ASPDHA6ND91 283 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 HRO43593 1189 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 SCGB2A1O75556 95 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 CEACAM5P06731 702 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ALOX5APP20292 161 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 C8orf44Q96CB5 159 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 YIPF6Q96EC8 236 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 PBX4Q9BYU1 374 aa14.58□□□□□ -0.08
TPCN1-201ENST00000335509 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms