RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.19■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RASD2Q96D21 266 aa15.19■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PELI2Q9HAT8 420 aa15.19■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TMEM212A6NML5 194 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 IDSB3KWA1 339 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 AIFM1O95831 613 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GDI1P31150 447 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R1AQ13522 171 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ASPGQ86U10 573 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RAB33BQ9H082 229 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 BHLHE40O14503 412 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 LILRB5O75023 590 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC11A1P49279 550 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MIDNQ504T8 468 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ALG10Q5BKT4 473 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 CDC42EP2O14613 210 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 FCGR2CP31995 323 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PKIAP61925 76 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DCST2Q5T1A1 773 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NPTNQ9Y639 398 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.18■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR2M5A3KFT3 312 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MBTPS2O43462 519 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 JTBO76095 146 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MISPQ8IVT2 679 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 CLDND1Q9NY35 253 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PRU2 124 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 F13BP05160 661 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PRLHRP49683 370 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 VWA2Q5GFL6 755 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC31A2O15432 143 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SELPP16109 830 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TACR3P29371 465 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MPGP29372 298 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DDTP30046 118 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GPR18Q14330 331 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TMEM255AQ5JRV8 349 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MITD1Q8WV92 249 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 Q9N2J8 555 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PQY0 241 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GATMP50440 423 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 EMP2P54851 167 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DOC2BQ14184 412 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NEK7Q8TDX7 302 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DIO2Q92813 273 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.17■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GWA3 101 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ZFPL1O95159 310 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 H2BFMP0C1H6 154 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SULT1A1P50225 295 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 FAM189A2Q15884 450 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 HAGHQ16775 308 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MAN2B1O00754 1011 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 THBS1P07996 1170 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RAB4AP20338 218 aa15.16■□□□□ 0.02
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