RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 SIAEQ9HAT2 523 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.73□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CUBNO60494 3623 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 A0A1W2PPL8 197 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM64BA6NI03 449 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 H3BN98 237 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RENP00797 406 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IGKV3-15P01624 115 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IGLV1-44P01699 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PIGFQ07326 219 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NPRL3Q12980 569 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SGCAQ16586 387 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZSCAN26Q16670 478 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC36A3Q495N2 470 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 LEG1Q6P5S2 330 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR2T33Q8NG76 320 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR4K13Q8NH42 304 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NABP1Q96AH0 204 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RADILQ96JH8 1075 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SNX18Q96RF0 628 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.72□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ARID1AO14497 2285 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 HS3ST1O14792 307 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC16A7O60669 478 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RAB36O95755 333 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CECR9P0C854 216 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CTLA4P16410 223 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF23P17027 643 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 CRABP1P29762 137 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SPOCK1Q08629 439 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC36A2Q495M3 483 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SLC22A25Q6T423 547 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SVOPLQ8N434 492 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 LNX2Q8N448 690 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC18Q8N456 261 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NMNAT3Q96T66 252 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 RERGLQ9H628 205 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 NOX3Q9HBY0 568 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.71□□□□□ -0.05
SFTPC-201ENST00000318561 SHISA9B4DS77 424 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 G3V2T6 193 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 HAX1O00165 279 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CELA3BP08861 270 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PATE4P0C8F1 98 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 OSMP13725 252 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 MSR1P21757 451 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 GIPRP48546 466 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CDH11P55287 796 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RAB1AP62820 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ETFDHQ16134 617 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 PGGHGQ32M88 737 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FAHD1Q6P587 224 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 NUAK2Q9H093 628 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 RNF121Q9H920 327 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.7□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 H3BNX3 289 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 CRYAAP02489 173 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 POU1F1P28069 291 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 LAP3P28838 519 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 DAPP51397 102 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 NAAAQ02083 359 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 FAM27BQ5VT28 67 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.69□□□□□ -0.06
SFTPC-201ENST00000318561 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms