RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283256.10

SCN2A-201, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN2A, Length 8,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-201ENST00000283256 CXADRP78310 365 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PLP2Q04941 152 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 AGBL4Q5VU57 503 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 RNF130Q86XS8 419 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 XYLT1Q86Y38 959 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 BVESQ8NE79 360 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR2T4Q8NH00 348 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SNX22Q96L94 193 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 FBXL18Q96ME1 805 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NEU1Q99519 415 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR51I1Q9H343 314 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PNPOQ9NVS9 261 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR2J3O76001 311 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NTSR1P30989 418 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 GRM3Q14832 879 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 UNC50Q53HI1 259 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 RNLSQ5VYX0 342 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SBSNQ6UWP8 590 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PITX2Q99697 317 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PBX4Q9BYU1 374 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TREM2Q9NZC2 230 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TRDCB7Z8K6 153 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NME2P1O60361 137 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 GRIN3BO60391 1043 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ITGB7P26010 798 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 BCL7AQ4VC05 210 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 MSS51Q4VC12 460 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 IL31RAQ8NI17 732 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SLC5A5Q92911 643 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SPTSSAQ969W0 71 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CPB2Q96IY4 423 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CGRRF1Q99675 332 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 HBP1O60381 514 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 FCGR3BO75015 233 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 OR1E1P30953 314 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CLRN1P58418 232 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SLC35B4Q969S0 331 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 FBXW5Q969U6 566 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NAA60Q9H7X0 242 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 CALHM2Q9HA72 323 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 VWA7Q9Y334 891 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 HSPB6O14558 160 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 POMCP01189 267 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ACP2P11117 423 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TACR1P25103 407 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PTGFRP43088 359 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 GAMTQ14353 236 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TCEAL1Q15170 157 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 UBE2V2Q15819 145 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 DACT2Q5SW24 774 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 NAXDQ8IW45 347 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 HIST1H4GQ99525 98 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 SYT11Q9BT88 431 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.72□□□□□ -1.65
SCN2A-201ENST00000283256 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms