RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TMUB2Q71RG4 321 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS45Q7RTY3 260 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 THAP4Q8WY91 577 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NSMAFQ92636 917 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL1Q9NR64 748 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A5Q9Y345 797 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A10O95528 541 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 WT1P19544 449 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GDI2P50395 445 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NUP54Q7Z3B4 507 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR4D10Q8NGI6 311 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF69Q9UC07 566 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 LRRN3E7EW58 273 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FMO6PO60774 539 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GABRA1P14867 456 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RAB3BP20337 219 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MMP15P51511 669 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MELKQ14680 651 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 AADACL4Q5VUY2 407 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF550Q7Z398 422 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RNF138Q8WVD3 245 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PSMF1Q92530 271 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF649Q9BS31 505 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 EMC3Q9P0I2 261 aa18.29■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF264O43296 627 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 UBL3O95164 117 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 CALCRP30988 508 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 IFNGR2P38484 337 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GPR4P46093 362 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RAB13P51153 203 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SSR4P51571 173 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OR1Q1Q15612 314 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 MEIOBQ8N635 442 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NR4A3Q92570 626 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RFKQ969G6 155 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF559Q9BR84 538 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 DNTTIP1Q9H147 329 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SURF4O15260 269 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GIPP09681 153 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OMPP47874 163 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF117Q03924 483 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TRAM2Q15035 370 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 OPN5Q6U736 354 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 GDF7Q7Z4P5 450 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC41A3Q96GZ6 507 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KLHDC3Q9BQ90 382 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 AUNIPQ9H7T9 357 aa18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PPP3CBP16298 524 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RAD52P43351 418 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NKAIN4Q8IVV8 208 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 EDARQ9UNE0 448 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK7Q9Y2U2 307 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0B4J203 849 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FAM183AA6NL82 134 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 NKX2-8O15522 239 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PRAF2O60831 178 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RAP2BP61225 183 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PITPNAQ00169 270 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 LGALS3BPQ08380 585 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ACSM1Q08AH1 577 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ST3GAL3Q11203 375 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM88Q6PEY1 159 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 IZUMO1Q8IYV9 350 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 PIGXQ8TBF5 258 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.27■□□□□ 0.52
UBE2B-201ENST00000265339 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HCRTR2O43614 444 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 GDNFP39905 211 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CCR4P51679 360 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms