RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 PGA4P0DJD7 388 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 PGA3P0DJD8 388 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CLRN1P58418 232 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 ASAH1Q13510 395 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 THEM4Q5T1C6 240 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 DCXRQ7Z4W1 244 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 OR4M2Q8NGB6 313 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 NEDD4LQ96PU5 975 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 BRD7Q9NPI1 651 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 MED12Q93074 2177 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 PDCD5O14737 125 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF432O94892 652 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TNFSF15O95150 251 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF43P17038 809 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CCR9P51686 369 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 RIDAP52758 137 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR148Q8TDV2 347 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 ST7LQ8TDW4 575 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 FREM3P0C091 2139 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 PLA2G10O15496 165 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 AQP8O94778 261 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHG1P01857 330 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 HRGP04196 525 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TALDO1P37837 337 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CD97P48960 835 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 H3F3AP84243 136 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TOMM20Q15388 145 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CARD17Q5XLA6 110 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 STAC2Q6ZMT1 411 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 NOXO1Q8NFA2 376 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 OR6X1Q8NH79 312 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 C11orf40Q8WZ69 217 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CLEC4AQ9UMR7 237 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 RAD1O60671 282 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 HLA-DQB1P01920 261 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 CORO6Q6QEF8 472 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TCF7L1Q9HCS4 588 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 STMN3Q9NZ72 180 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN13-201ENST00000262067 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR171O14626 319 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 F10P00742 488 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF17P17021 662 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 HES5Q5TA89 166 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIQKQ629K1 86 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 PIGQQ9BRB3 760 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 IFITM5A6NNB3 132 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 LAP3P28838 519 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 CYB561P49447 251 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR85P60893 370 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 MFAP5Q13361 173 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 IL17RDQ8NFM7 739 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC39A7Q92504 469 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM106AQ96A25 262 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 KCNJ15Q99712 375 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 DEPPQ9NTK1 212 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 SPATA2Q9UM82 520 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 V9GY05 133 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 CACNA1CQ13936 2221 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 ADRA2CP18825 462 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 SRD5A2P31213 254 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 PITPNBP48739 271 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 B3GALT5-AS1P59052 145 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 RAC1P63000 192 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 CD300CQ08708 224 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRTM1Q86UE6 522 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 CATSPERDQ86XM0 798 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF671Q8TAW3 534 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 SLITRK2Q9H156 845 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A0J9YW62 118 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A1W2PPL8 197 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 AIPO00170 330 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 RAF1P04049 648 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 RFPL3SP0C7P2 107 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 PIP4P1Q86T03 277 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 UBE2J2Q8N2K1 259 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN13-201ENST00000262067 LGALS14Q8TCE9 139 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms