RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 STK35Q8TDR2 534 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MAL2Q969L2 176 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PHF21AQ96BD5 680 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 OXGR1Q96P68 337 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RMND5AQ9H871 391 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.72□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 UBDO15205 165 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 AHSA1O95433 338 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PATE4P0C8F1 98 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 CCL2P13500 99 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RASSF2P50749 326 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BPIFB3P59826 476 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PMS2P3Q13401 168 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYND11Q15326 602 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MOGQ16653 247 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF774Q6NX45 483 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf111Q8N326 155 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 FITM2Q8N6M3 262 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD8Q8NHS3 518 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35B4Q969S0 331 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 FOXB1Q99853 325 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 IFT52Q9Y366 437 aa13.71□□□□□ -0.21
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 H0YHG0 523 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MFN2O95140 757 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SNAP29O95721 258 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MPIG6BO95866 241 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 HTR2AP28223 471 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 FADDQ13158 208 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CARD17Q5XLA6 110 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MIER2Q8N344 545 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BBS10Q8TAM1 723 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L14Q9BZR8 327 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SAR1AQ9NR31 198 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 POFUT2Q9Y2G5 429 aa13.7□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 K7EIL1 84 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CLIC1O00299 241 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 UCP2P55851 309 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BTG1P62324 171 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 EGR3Q06889 387 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BNIP1Q12981 228 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GPR157Q5UAW9 335 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 EPGNQ6UW88 154 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SKA3Q8IX90 412 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ICA1LQ8NDH6 482 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A36Q96CQ1 311 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LRR1Q96L50 414 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC11Q96RL6 698 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CDH20Q9HBT6 801 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM106BQ9NUM4 274 aa13.69□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CEACAM18A8MTB9 384 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-59P01825 116 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CD55P08174 381 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 THRBP10828 461 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ETS2P15036 469 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAR1BP31321 381 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 C1DQ13901 141 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LSMEM1Q8N8F7 131 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf10Q9HB07 376 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLAMF8Q9P0V8 285 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.68□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.67□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GWA3 101 aa13.67□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM247A6NEH6 219 aa13.67□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD65E5RJM6 399 aa13.67□□□□□ -0.22
SPCS1-201ENST00000233025 M0R082 166 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms