RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641225.1

TNNT3-217, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

BASIC

Gene TNNT3, Length 877 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-217ENST00000641225 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.78□□□□□ -0.04
TNNT3-217ENST00000641225 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.78□□□□□ -0.04
TNNT3-217ENST00000641225 SPEF2Q9C093 1822 aa14.78□□□□□ -0.04
TNNT3-217ENST00000641225 RTL9Q8NET4 1388 aa14.77□□□□□ -0.04
TNNT3-217ENST00000641225 SCN9AQ15858 1988 aa14.77□□□□□ -0.04
TNNT3-217ENST00000641225 PDE8AO60658 829 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 UFL1O94874 794 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ECE1P42892 770 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.77□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 AOC2O75106 756 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 IGKV5-2P06315 115 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 GGA1Q9UJY5 639 aa14.76□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 MYH3P11055 1940 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 G3V3G9 751 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 EGFRP00533 1210 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 DLK2Q6UY11 383 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 KSR2Q6VAB6 950 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 USP48Q86UV5 1035 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 WWC1Q8IX03 1113 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 STK31Q9BXU1 1019 aa14.75□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CTSWP56202 376 aa14.74□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CCDC27Q2M243 656 aa14.74□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.74□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 PSME4Q14997 1843 aa14.73□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.73□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 G2E3Q7L622 706 aa14.73□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.73□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 XDHP47989 1333 aa14.72□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ADM5C9JUS6 153 aa14.72□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.72□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 MRS2Q9HD23 443 aa14.72□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 IL16Q14005 1332 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 SLC4A2P04920 1241 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 MAP2K2P36507 400 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 GREM2Q9H772 168 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 TSKSQ9UJT2 592 aa14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TNNT3-217ENST00000641225 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ATP2B4P23634 1241 aa14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 HUNKP57058 714 aa14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 GGA3Q9NZ52 723 aa14.7□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.69□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ZNF609O15014 1411 aa14.69□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 FLIIQ13045 1269 aa14.69□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 H7C1W4 665 aa14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 MED23Q9ULK4 1368 aa14.68□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 GCKRQ14397 625 aa14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 SULF1Q8IWU6 871 aa14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ZIC5Q96T25 663 aa14.67□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 USP17L3A6NCW0 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 USP17L4A6NCW7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ANP32CO43423 234 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 SCARF1Q14162 830 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 PODNQ7Z5L7 613 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 GMLQ99445 158 aa14.66□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 CACNA1FO60840 1977 aa14.65□□□□□ -0.06
TNNT3-217ENST00000641225 USP17L8P0C7I0 530 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms