RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC85CA6NKD9 419 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMBP2O15034 1052 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ECE2O60344 883 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 HUNKP57058 714 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D16Q8TBP0 767 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MCOLN1Q9GZU1 580 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 NOGQ13253 232 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 DOK7Q18PE1 504 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP44Q96MT7 982 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf229H3BNL8 230 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS12P25398 132 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 HYPKQ9NX55 129 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ADM5C9JUS6 153 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF853P0CG23 659 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT26Q7Z3Y9 468 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 MBIPQ9NS73 344 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC31BQ9NQW1 1179 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PODXL2Q9NZ53 605 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 EYA3Q99504 573 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF609O15014 1411 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RGMBQ6NW40 437 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC34A2O95436 690 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF521Q96K83 1311 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PSME4Q14997 1843 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 APAF1O14727 1248 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GGA3Q9NZ52 723 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKZQ13574 1117 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 UFL1O94874 794 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC27Q2M243 656 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GMLQ99445 158 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 MYD88Q99836 296 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GGA1Q9UJY5 639 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A3P09131 477 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA2Q08379 1002 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC102AQ96A19 550 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA5Q96FF9 252 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT57Q9NWB7 429 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF186Q9NXI6 227 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE8AO60658 829 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SULF1Q8IWU6 871 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CSRNP1Q96S65 589 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SCARF1Q14162 830 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPA1O75762 1119 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 XDHP47989 1333 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAI1P63096 354 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RASAL3Q86YV0 1011 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV5-2P06315 115 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR63Q8IWG1 891 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPYL6Q8N831 410 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOZ2Q9NPC6 264 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 WWC1Q8IX03 1113 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 G3V3G9 751 aa30.78■■■□□ 2.52
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