RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 CTSWP56202 376 aa26.61■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 GLTPD2A6NH11 291 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 KIF3CO14782 793 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 JDP2Q8WYK2 163 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH1L1O75891 902 aa26.59■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 SEC24BO95487 1268 aa26.59■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.59■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.59■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.58■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 RRAGCQ9HB90 399 aa26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 GRM8O00222 908 aa26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 CASP7P55210 303 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 GREM2Q9H772 168 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 SNED1Q8TER0 1413 aa26.55■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 PPIP5K2O43314 1243 aa26.55■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 VPS33BQ9H267 617 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf229H3BNL8 230 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 AOC3Q16853 763 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.53■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.52■■□□□ 1.84
SGMS1-210ENST00000619438 CSF1RP07333 972 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA6P23229 1130 aa26.51■■□□□ 1.83
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SGMS1-210ENST00000619438 GPSM2P81274 684 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 NIM1KQ8IY84 436 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 LNPKQ9C0E8 428 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 CEP350Q5VT06 3117 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 FZD9O00144 591 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 DCTPP1Q9H773 170 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 WASHC4Q2M389 1173 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 TOMM70O94826 608 aa26.48■■□□□ 1.83
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SGMS1-210ENST00000619438 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A1P02462 1669 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 RTL9Q8NET4 1388 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.47■■□□□ 1.83
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SGMS1-210ENST00000619438 EYA3Q99504 573 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 WDR90Q96KV7 1748 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 RIMBP2O15034 1052 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 POLLQ9UGP5 575 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 GGA1Q9UJY5 639 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 MYH3P11055 1940 aa26.45■■□□□ 1.83
SGMS1-210ENST00000619438 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 CEP85Q6P2H3 762 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A5P29400 1685 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 UFL1O94874 794 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 SUCLG2Q96I99 432 aa26.44■■□□□ 1.82
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SGMS1-210ENST00000619438 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 G3V3G9 751 aa26.44■■□□□ 1.82
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SGMS1-210ENST00000619438 GPC2Q8N158 579 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 XDHP47989 1333 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 POTECB2RU33 542 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 BECN1Q14457 450 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 USP44Q9H0E7 712 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 UTYO14607 1347 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 MEIS3Q99687 375 aa26.42■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 ATP2B4P23634 1241 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A3P48751 1232 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-210ENST00000619438 NBR1Q14596 966 aa26.39■■□□□ 1.82
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