RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 JPH4Q96JJ6 628 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM13AO94988 1023 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 IFT74Q96LB3 600 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PPFIA2O75334 1257 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 E7EVH7 732 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 NBPF11Q86T75 865 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 GIPC1O14908 333 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 USP16Q9Y5T5 823 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP2R5CQ13362 524 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP5DP30049 168 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 MGEA5O60502 916 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 STMN1P16949 149 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT86O43790 486 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 HLA-DOAP06340 250 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 KIFC2Q96AC6 838 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CABP5Q9NP86 173 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 TXNDC9O14530 226 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 FYB2Q5VWT5 728 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 BAG3O95817 575 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 TCHPQ9BT92 498 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF131P52739 623 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 INF2Q27J81 1249 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GUA9 196 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PPFIA3O75145 1194 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 PLS1Q14651 629 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 GABPAQ06546 454 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 SYT1P21579 422 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP7Q14244 749 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 SKILP12757 684 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC89Q8N998 374 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-207ENST00000613246 CALM1P0DP23 149 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 CALM2P0DP24 149 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 CALM3P0DP25 149 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT83P78385 493 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 ITIH3Q06033 890 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 VCXQ9H320 206 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 VAV2P52735 878 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 HPDP32754 393 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC43Q8N309 656 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 HAND2P61296 217 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 SMARCA2P51531 1590 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 CAVIN2O95810 425 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 C6orf229H3BNL8 230 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 CLUL1Q15846 466 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 NEK11Q8NG66 645 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 BICDL2A1A5D9 508 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 UBXN1Q04323 297 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC62Q6P9F0 684 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPY3P0CV98 308 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPY8P0CW00 308 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-207ENST00000613246 STX8Q9UNK0 236 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms