RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596559.5

ZNF28-208, Transcript of zinc finger protein 28, human

TSL 5

Gene ZNF28, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF28-208	ENST00000596559	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	MDFI	Q99750	246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TET3	O43151	1660 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	C9orf172	C9J069	976 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TRIM37	O94972	964 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	GNRH1	P01148	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TNP2	Q05952	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ZNF28-208	ENST00000596559	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	SELP	P16109	830 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	IRAK1	P51617	712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	MST1R	Q04912	1400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	VPS72	Q15906	364 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	GPR162	Q16538	588 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559		M0R082	166 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	NID1	P14543	1247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	HSPA6	P17066	643 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ALAS2	P22557	587 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PRELP	P51888	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	UNC13B	O14795	1591 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	KANK1	Q14678	1352 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	FOXO3	O43524	673 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ATP4A	P20648	1035 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	JAG1	P78504	1218 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	EP400	Q96L91	3159 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	DCC	P43146	1447 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ALB	P02768	609 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	GLI3	P10071	1580 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ZNF28-208	ENST00000596559	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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